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1、補料速率與比生長速率直接影響著乙酸的生成速率和積累量，所以適當?shù)目刂蒲a料速率和比生長速率，對于控制乙酸的量有很好的效果。2、必須要保證充足的溶氧，并嚴格控制pH值，而且補酸堿的速率盡量緩和，不能太快；溫度對于蛋白的表達也有很重要的影響，較低的發(fā)酵溫度下所生產(chǎn)出的蛋白大多是有活性的，而較高的發(fā)酵溫度下產(chǎn)生的蛋白大多一包涵體形式存在。 3、選取合理的誘導時間非常重要，一般的誘導時間選在指數(shù)生長后期，而且誘導時的比生長速率最好能控制在0.2之內(nèi)，選在此時誘導，優(yōu)勢是：（1）將菌體的快速生長期與蛋白合成期分開，使這兩個階段互不影響，有利于蛋白的高表達；（2）已經(jīng)得到了大量的菌體，而且菌體的生物量基本接近穩(wěn)定，不論是從動力學角度，還是能耗，物料成本方面，都比較合理。 4、補料過程中的碳氮比也很重要。若氮源過高，會使菌體生長過于旺盛，pH偏高，不利于代產(chǎn)物的積累；氮源不足，則菌體繁殖量少從而影響產(chǎn)量；碳源過多，則容易形成較低的pH，抑制菌體生長；碳源不足，則容易引起菌體的衰老和自溶。另外，碳氮比不當還會引起菌體按比例的吸收營養(yǎng)物質(zhì)，從而直接影響菌體的生長和產(chǎn)物的合成。 5、一般情況下，對于一個穩(wěn)定的發(fā)酵工藝下，如果總是在固定的發(fā)酵時間段出現(xiàn)溶菌現(xiàn)象，而且能排除噬菌體和染菌的可能性后，那就可能是因為碳氮比不合理造成的?？梢赃m當調(diào)整碳氮比。
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通氣控制的核心原則是要保持體系中的DO能夠維持在臨界氧濃度以上。因為空氣成本占比較高，對于大型企業(yè)，常常通過調(diào)節(jié)通氣流量分配實現(xiàn)節(jié)能降耗的效果。一些企業(yè)會在發(fā)酵初期微開空氣，等溶解氧下降到一定的水平再慢慢開大空氣，這是因為在前期，生產(chǎn)菌較少消耗氧氣，如果開大空氣，則通入的空氣不能轉(zhuǎn)換成溶解氧，造成浪費。
調(diào)節(jié)空氣流量是通過改變液體中氣泡量和氣泡在發(fā)酵液中保持時間來改變Kla的。試驗證明通氣流量增大可提升溶解氧，但是到一定程度時，空氣流量增加對溶解氧增加的效果會非常小，除了傳質(zhì)勢能降低外，另外一個重要原因是：空氣流量增加到一定程度，氣泡的體積將增加，極限的情況會產(chǎn)生氣流短路，這些情況并不能有效提升氣泡的表面積，另一方面氣體流速增加，將導致氣泡在發(fā)酵液中保持時間變短。
由于通氣流量和攪拌對Kla關(guān)系上有交互作用，所以在對DO控制上，僅使用通氣流量或攪拌與DO進行偶聯(lián)，都存在一定的片面性。
Kla、DO和OUR
KLa，表征生物反應過程氧傳質(zhì)效能的重要指標。對很多產(chǎn)品，KLa與發(fā)酵結(jié)果之間存在著緊密的對應關(guān)系，因此，以Kla為放大準則，已成為生物化工界一個廣泛接受的觀點。影響KLa 指標除設(shè)備性能外，發(fā)酵過程本身也影響著KLa，有研究顯示，發(fā)酵溫度、發(fā)酵液粘度、空氣流量、罐壓等指標也是影響KLa的指標。

上圖給出了參數(shù)的計算方法，請注意，第一個公式代表進入發(fā)酵罐